La Garonne, site Natura 2000, est un axe piscicole. Présentant des risques d'inondation, ce fleuve est un élément structurant du paysage au pied des coteaux de Floirac.
Le caractère urbain et industriel des lieux est historiquement lié aux activités portuaires de la Garonne : présence ponctuelle d’habitat, grands axes routiers structurants, zones de friches industrielles ou en cours de réaménagement.
La proximité avec le secteur inscrit au Patrimoine Mondial de l'UNESCO implique l'existence de vastes parcelles identifiées comme sensibles d’un point de vue archéologique de même que la présence en rive droite d’installations sur pilotis, les « carrelets », utilisés pour la pêche.
La Garonne est également un milieu naturel fréquenté par de nombreuses espèces animales, sur les milieux en friches notamment (triton palmé, crapaud calamite...).